PCR檢測試劑盒PCR反(fan)應引(yin)物設(she)計(ji)原(yuan)則(ze):
PCR反(fan)應中有(you)兩(liang)條引(yin)物,即5′端(duan)引(yin)物和3′引(yin)物。設(she)計(ji)引(yin)物時(shi)以壹(yi)條DNA單(dan)鏈(lian)為(wei)基準(常以信息(xi)鏈為(wei)基準),5′端(duan)引(yin)物與位(wei)於(yu)待(dai)擴增(zeng)片段5′端(duan)上(shang)的壹(yi)小段DNA序列相(xiang)同;3′端(duan)引(yin)物與位(wei)於(yu)待(dai)擴增(zeng)片段3′端(duan)的壹(yi)小段DNA序列互補(bu)。PCR檢測試劑盒PCR反(fan)應引(yin)物設(she)計(ji)的基(ji)本原(yuan)則(ze)如下(xia):
(1) 引物(wu)長度:15-30 bp,常(chang)用為(wei)20 bp左右。
(2) 引物堿基(ji):G+C含量(liang)以(yi)40-60%為(wei)宜,G+C太(tai)少(shao)擴增(zeng)效果(guo)不(bu)佳(jia),G+C 過多易出現非特(te)異(yi)條帶。ATGC最好隨(sui)機分(fen)布,避(bi)免(mian)5個以(yi)上的嘌(piao)呤或(huo)嘧(mi)啶核(he)苷(gan)酸的成串(chuan)排列。
(3) 引(yin)物(wu)內部不(bu)應(ying)出現互補(bu)序列。
(4)兩個引(yin)物之(zhi)間不(bu)應(ying)存在互補(bu)序列,尤(you)其(qi)是避(bi)免(mian)3 ′端(duan)的互補(bu)重疊。
(5) 引物與(yu)非特(te)異(yi)擴增(zeng)區(qu)的序列的同源(yuan)性不(bu)要(yao)超過70%,引(yin)物(wu)3′末(mo)端(duan)連(lian)續8個(ge)堿基(ji)在待(dai)擴增(zeng)區(qu)以(yi)外(wai)不(bu)能(neng)有(you)全互補(bu)序列,否則(ze)易導致非特(te)異(yi)性擴增(zeng)。
(6)引(yin)物(wu)3‘端(duan)的堿基(ji),特(te)別(bie)是最末(mo)及(ji)倒(dao)數第二(er)個堿基(ji),應嚴格要(yao)求(qiu)配對,選擇(ze)是G和C。
(7) 引(yin)物(wu)的5 ′端(duan)可以修飾(shi)。如附(fu)加(jia)限(xian)制酶(mei)位(wei)點(dian),引(yin)入突(tu)變(bian)位(wei)點(dian),用生(sheng)物su、熒(ying)光物(wu)質(zhi)、di 高辛標記,加入其(qi)它短(duan)序列,包括起(qi)始(shi)密(mi)碼(ma)子、終止(zhi)密(mi)碼(ma)子等。