PCR檢測(ce)是(shi)壹種(zhong)基於(yu)聚(ju)合酶鏈式反應(Polymerase Chain Reaction)技術的(de)分子生物學(xue)檢測(ce)方(fang)法(fa),主要用於(yu)擴(kuo)增(zeng)和(he)檢測(ce)特(te)定DNA或RNA序(xu)列。
壹、PCR檢測(ce)的(de)基本原理(li)
1、DNA擴(kuo)增技(ji)術(shu):PCR通(tong)過(guo)模(mo)擬(ni)DNA自(zi)然復(fu)制(zhi)過(guo)程(cheng),在體(ti)外對(dui)特(te)定DNA片(pian)段(duan)進行(xing)指(zhi)數(shu)級(ji)擴增(zeng)。核(he)心(xin)步驟(zhou)包括:
變性:高溫(93℃)使雙(shuang)鏈DNA解(jie)離(li)為單(dan)鏈。
退(tui)火:降(jiang)溫(58℃)使引(yin)物與(yu)單(dan)鏈DNA結(jie)合。
延伸:DNA聚(ju)合酶在72℃催化(hua)下(xia)合(he)成(cheng)新(xin)鏈。
2、循(xun)環(huan)重(zhong)復(fu):上述(shu)步驟循(xun)環(huan)30-35次(ci),目(mu)標(biao)DNA片(pian)段(duan)數(shu)量(liang)呈指(zhi)數(shu)增(zeng)長(chang)(2^n倍),實現(xian)微量(liang)樣本(ben)的(de)可檢測(ce)性。
二、PCR檢測(ce)的(de)標(biao)準(zhun)操作流(liu)程(cheng)
1、反應體系配置(zhi):
l 在無菌離心(xin)管中(zhong)混合(he):10×PCR緩沖(chong)液(5μl)、dNTP混合(he)液(4μl)、引(yin)物1和(he)引(yin)物2(各(ge)2μl)、Taq酶(1μl)、DNA模(mo)板(ban)(1μl)、無核酸酶水補(bu)足至(zhi)50μl。
l 若PCR儀無熱蓋,需(xu)添(tian)加石(shi)蠟(la)油防(fang)止(zhi)蒸發。
2、擴增(zeng)程(cheng)序(xu):
l 預(yu)變性:93℃加熱(re)3-5分鐘。
l 循(xun)環(huan)階(jie)段(duan):93℃變性40秒 → 58℃退(tui)火30秒(miao) → 72℃延伸60秒(miao),重(zhong)復(fu)30-35次(ci)。
l 最(zui)終(zhong)延(yan)伸(shen):72℃保溫(wen)7分鐘。
3、結果(guo)處理(li):
l 產(chan)物置(zhi)於(yu)4℃短(duan)期保存(cun)或-20℃長(chang)期保存(cun)。
l 電(dian)泳(yong)檢測(ce):若含石(shi)蠟(la)油需(xu)用氯(lv)仿(fang)抽提去(qu)除,取(qu)5-10μl樣本(ben)進行(xing)凝(ning)膠電(dian)泳(yong)。
三(san)、特(te)殊場景(jing)註(zhu)意(yi)事(shi)項(xiang)
1、菌液PCR操作
l 直接(jie)使用熱(re)解菌(jun)液(10μL LB培(pei)養基重(zhong)懸單(dan)菌落)作為模(mo)板(ban)。
l 加(jia)樣需(xu)在超(chao)凈(jing)臺(tai)內完(wan)成,避(bi)免雜菌汙染。
2、高GC含量(liang)模(mo)板(ban)擴(kuo)增
l 增(zeng)加DMSO至(zhi)5-10%(v/v)降低二級(ji)結(jie)構(gou),使用熱(re)啟(qi)動酶(如HotStart Taq)。
l 提高預(yu)變性溫度(du)至(zhi)98℃,延長(chang)變性時間至(zhi)10分鐘。
PCR檢測(ce)作(zuo)為(wei)分子診(zhen)斷(duan)核心(xin)工具(ju),其(qi)技術叠(die)代(dai)與(yu)規範(fan)化(hua)應用將(jiang)持(chi)續(xu)深(shen)化(hua)在(zai)傳(chuan)染病(bing)防控、腫(zhong)瘤(liu)診(zhen)療及(ji)寵(chong)物健(jian)康(kang)等領(ling)域(yu)的(de)價(jia)值,但需(xu)警(jing)惕技術(shu)濫用與(yu)數(shu)據安全風(feng)險(xian)。